失去双亲的Peter（郭富城饰）在哥哥Greg（吕良伟饰）的庇护下衣食无忧，整日沉浸在电脑世界中。不料，当2000年来临时他的生活却发生了翻天覆地的变化。哥哥Greg因参与编写国防用的软件炸弹，被联邦调查局怀疑出卖情报而遭杀害，香港政治部的Ronald（吴镇宇饰）介入调查此事。突发的变故令Peter一夜间成熟起来，他坚信哥哥绝不会做出卖国家利益的事情。于是，他与好友Benny（吴彦祖饰）、女友Janet（蔡乐芝饰）一起飞往新加坡调查事件的真相。 在调查的过程中，Peter突然遇到了自称是Greg未婚妻的Salina（郭妃丽饰），并且从她那里得知美国CIA的Kelvin（连凯饰）另有阴谋。而就在他们久寻答案不获之时，Benny发现了Greg出事前拷贝的两个软件程序。而这份有关千年虫的软件关系着国防的安危，关系着众多行业的命脉，也关系着Greg的清白。于是Peter与死党们继续追踪并与新加坡政府所派的Eric（赖兴祥饰）进行暗中调查合作，终于发现了一个惊天大秘密。