乞颜族大汗也速该为报年前惨败耻辱，养精蓄锐偷袭塔塔儿族，终于获凯旋而归。适逢月伦皇后诞下麟儿，取名铁木真。也速该为普天同庆，特释放塔塔儿族俘虏，令人皆大欢喜。 多年后也速该被塔塔儿族杀害，临死前托部下蒙力克照顾其家人。蒙力克顺理成章对月伦等尽忠照顾，后来甚至娶月伦为妻，成为铁木真的后父。 别克嫉妒同父异母兄弟铁木真与合撒儿受到蒙力克偏爱，常与亲弟古台向铁木真撩事斗非。其后合彻儿在一次纷争中不慎错手杀死别克。铁木真替其承担罪状，受到月伦严斥。泰亦赤族见自也速该去世后，其他族人相继离去，群龙无首，加上铁木真日渐长大，恐日后会将乞颜族势力扩张，遂连夜派兵突袭，欲将铁木真一家斩草除根。 月伦见敌人来势汹汹，立刻带领族人逃命。但铁木真感到泰亦赤族主要因他而来攻，不想连累族人，决只身杀出重围，以引开敌方注意。

铁木真受到敌军追捕，终逃命至山上，饥寒交迫之下，迷糊中隐约听到亡父鼓励，遂触发起其十多年前的回忆。 当年也速该携铁木真到翁吉拉族求亲，族长德薛禅一口答应将爱女孛儿帖许配予铁木真，也速该遂依俗例将铁木真留于族内一年，而自己先行回家。 怎料当也速该回程路过塔塔儿族时，被邀留下饮宴，终不虞有诈暗被毒害，回家后毒发身亡，铁木真亦匆匆被接回家奔丧。 铁木真匿于山上多日后，感到自己身为大汗之子，为顾全乞颜族的体面，决冒死闯下山与泰亦赤族一拚，终不敌被掳，饱受鞭挞之苦。 身为乞颜族俘虏的赤老温与合答安兄妹目睹铁木真受尽折磨，甚有不忍之心，乘泰亦赤人大肆庆祝时，协助铁木真越囚。其后铁木真被敌兵穷追，幸得老温父锁儿老爹掩护逃脱。 赤老温见铁木真逃命至其家求助，本著彼此青梅之交，与家人冒险将他藏身于羊毛车里。铁木真虽侥幸脱险，却不慎被敌兵所伤。

铁木真得合答安悉心照料下，伤势渐愈。其实合答安早在乞颜族时，已对铁木真暗生情愫，患难中重逢后，彼此感情愈见深厚。 铁木真因惦念著家人安危，迫于与合答安分手。当他返家途中，再遇敌方追捕，幸得札木合仗义相救，二人惺惺相惜，立结为「安答」。札木合之弟怡察及三察因嫉妒铁木真英勇骠悍，对他甚有排斥之意。 铁木真得札木合护送下，返回乞颜族与家人团聚。众人见他安然归来，大表惊喜，庆祝一番。 月伦眼见铁木真已长大成人，著合撒儿陪他往翁吉拉族提亲，但铁木真自觉家境不如，对这头婚事不敢存奢望，姑且一试。 怎料当铁木真拜会德薛禅时，受到其家人热情款待，并欣然将孛儿帖交托铁木真手上。德薛禅除预备了丰厚的嫁妆外，更教导铁木真应召集离散的族人回归，重整家园，以继承也速该的大业。 孛儿帖嫁入乞颜族后，凭其温柔娴淑的性格，甚获月伦与速赤欢心，令家中呈现新景象。

铁木真为召集旧部联盟重整家业，特向其父生前之安答别里求助。可惜别里生性贪财、反复，随意敷衍铁木真。加上别里之子桑昆向对铁木真存敌意，更在一次竞技中当众败于其手上，对他倍增妒恨。 蔑儿克族寺列都为报当年也速该抢去月伦为妻之仇，出兵硬抢孛儿帖回来。列都子赤勒垂涎孛儿帖美色，逼她改嫁自己，孛儿帖虽不肯就范，终被制服，大施淫暴。 铁木真不忍爱妻被掳，请求别里领导其兄弟抢回孛儿帖，札木台为著安答之情，亦答允同闯入蔑儿克族。孛儿帖终安然返家，但速赤兵荒马乱中不幸被杀。 札木合目睹孛儿帖庐山真面后，不禁被其娇艳花容所吸引，对他暗生爱慕之情。其后他每见到铁木真与儿帖亲暱状时，内心既妒且恨。 合答安被迫嫁予一泰亦赤族人，因她对铁木真情深一片，心有不甘，欲跟随赤老温投奔铁木真，向他剖白一切。当她目睹铁木真与妻恩爱非常时，不忍破坏其幸福，黯然离去，无奈答允婚事。

孛儿帖回家后，发现自己暗结赤勒珠胎，坦言相告铁木真。铁木真虽心感不快，但体恤爱妻苦况，未因此而轻视她，还视此初生婴儿术赤视为己出之长子。 札木合苦苦痴缠孛儿帖，但她对夫专情，未被所动。札木合因妒成恨，硬逼孛儿帖就范，要她反过来与铁木真作对，被铁木真揭发，对札木合已起戒心，决离开札木合的部族，自力更生建立自己的家族。 铁木真自大败蔑儿克族一役后，渐表露了其军事与作战之才智，使离散的部族逐渐回归。另一方面，他晓得知人善任，招揽如木华黎与赤老温等人才，合力替他巩固势力。其后他获部下拥护，推举为大汗。 札木合眼见铁木真势力日渐强大，加上恼恨孛儿帖对铁木真死心塌地，十分妒恨，决不顾结义之情，暗中准备攻打铁木真。 当铁木真擭悉札木合出兵，立刻率领部下以寡敌众，终凭其英勇的作风，将札军节节败退。怡察不敌战死沙场，令札木合对铁木真怨恨更深。

铁木真深明若不先发制人，终有一日被消灭的道理，休养生息之后，得其良师益友塔塔统指点，从南方桃花石领悟到的军事知识，加上铁木真的才智，将泰亦赤族一举歼灭。 铁木真在泰亦赤人的俘虏当中，发现合答安的踪迹，眼见她丈夫已战死，无家可归，收留她在乞颜族中居住。 别里见铁木真气势凌厉，借词向他收取贡品，以探其虚实。铁木真感到暂时还要依靠别里势力，忍痛将大部份牲畜财物送予他，并故意掩盖实力，暗布下戒备。 桑昆邂逅合答安，对她一见钟情，随即向她提出婚事。合答安对铁木真余情未了，坚拒婚事，令桑昆大为震怒。 蒙力克自铁木真打败泰亦赤族时，自感责任已完，不敢留在月伦身边，四处流浪。其后他无意中获悉札木合为报弟仇，四出拉拢兵马，联手攻打乞颜族，遂马上警告铁木真。月伦等与他久别重逢，极力挽留他在族内。

铁木真自知军力菲薄，不敌于札木合，急往向别里借兵。怎料桑昆自小与铁木真不和，向别里进谗，反与札木合联手对付铁木真。别里终为所动，对铁木真避而不见，遂激发起铁木真自力更生，排除外敌之心。 铁木真凭其独到的才智，运筹帷握布下战略，将札木合的军队引入深谷内，只派出精兵壮士出征，将札木合军队大举歼灭，令其元气大伤。 札木合败阵而逃，对铁木真仇恨更深。但已无能再起反抗，将满腔怒忿泄在战俘与自己的手下身上，残杀无道，从此尽失民心，声誉大减。 铁木真苦难期间，合答安长伴其身旁悉心照顾。孛儿帖冷眼旁观，感到合答安对他情深一片，便成其好事，安排铁木真正式迎娶合答安。

十数年后，乞颜族经过一段长时期的休养生息后，生活渐入丰盛，势力日渐稳固。 别里被亲兄弟夺去汗位，并将其父子二人赶出族外，迫于向铁木真求助。铁木真不计旧怨，答允替别里夺回汗位。 铁木真感杀父之仇未报，欲乘塔塔儿族势力渐弱，倾全力大举进攻。 当铁木真向别里提出联盟时，别里暗垂涎塔塔儿族的丰盛珍贵宝物，欲乘机掠夺，乃答允铁木真所求。 铁木真派兵夹道攻打塔塔儿族时，原来其族已被金兵打败，气数已尽。铁木真亦将其首领宓古真之性命，偿还也速该之血海深仇。 铁木真凭金人势力，将宓古真之首级献予金国丞相王京时，受到王京傲慢无礼对待，并封他招讨官，利用他效力金人统治蒙古人。铁木真不忍受辱，立誓自强统领天下。

札木合眼见铁木真与别里联盟后，势力大增，更存恐惧之心，于是结合其他小部族，欲借此赶铁木真出大漠。怎料被一歌姬百合暗中向铁木真告密，铁木真有备而战。 当札木合挥大军攻打乞颜族时，下令神箭手哲别专意行刺铁木真。铁木真终负伤而逃，令族中军心大乱。 别里见乞颜族群龙无首，立背叛铁木真向札木台议和，以图归附旗下。 铁木真见军力疲弱，下令休战，并广纳哲别等贤才，休养生息一轮，伺机重振声威。 铁木真见百合虽为歌姬，但品性纯良，将她许配予合撒儿，二人恩爱非常。 札木台为歼灭铁木真，利用别里与铁木真议婚，暗中布下兵马，务求将铁木真置诸死地。窝阔台有勇无谋，身受重伤，令铁木真大表焦虑。

札木合发现百合背叛自己，将她掳走，以分散铁木真注意。合撒儿擅自离开部众寻找爱妻，可惜百台已遭札木合毒手，令他大为痛心，决助铁木真向札木合报仇。 铁木真拚死而战，杀出重围，终将札木合击败，而桑昆迫于逃往西夏，以抢劫为生。 札木合走投无路，向太阳汗借兵，直驱铁木真部族，不敌，临死前要求铁木真准他以贵族的方式了结生命。铁木真本著结义一场，慨然答允所求。 札木合死后，铁木真消灭太阳汗，继而收服其他部族，统一蒙古族，称帝「成吉思汗」。