宋仁宗年期，包拯寻回通天犀有功，获高昌王赐婚。公孙策、展昭、四捕快保护包拯赴高昌，迎娶公主；途中遇上强抢婚礼新郎的云千羽，展昭出手制止。公孙策为免千羽缠扰新郎，借词让她随行；二人行酒令，酩酊大醉，木匠杜江见状将千羽安顿店中。包拯与公主拜堂，发现新娘为侍女纪念念。王府收到公主断指，包拯率众调查，揭破公主与画师私奔。画师被杀，凶手是杀害展昭兄长的采花贼花蝴蝶。花蝴蝶现身，更以公主性命要胁包拯当众自宫。

众人翻查案件，怀疑花蝴蝶为木匠杜江，惜缉凶不果。千羽发现杜江家藏胎毛笔，杜江指花蝴蝶另有其人。及后花蝴蝶现身被拿下，花蝴蝶竟是杜江！此事越来越诡异，千羽力证杜江非花蝴蝶，幸好包拯发现端倪。众人带花蝴蝶杜江到崖边，却见杜江尸首！花蝴蝶道出事情始末。四捕快成功救出公主，花蝴蝶遭斩首示众。公主痛失情郎，婉拒与包拯的婚事。念念被高昌王辞退，众人使计让包拯同意偕念念同行。包拯上任开封府尹，获御赐三口铡刀……

王员外伏尸妓院解语轩后巷，众人查验后断定他被女子用湘妃竹所杀。展昭、王朝早有心结，却一同被安排混入解语轩当细作。展昭向老板水玲珑提议以女子相扑招徕客人，玲珑命二人教妓女相扑。千羽抢新郎之事传到开封，其父云中流、谊妹汤晓晨使计羞辱朱家庆，以报复他宣扬此事。展昭、王朝试探众妓女，却得悉玲珑武功不凡。中流涉谋杀王员外被捕，受审时却有所隐瞒，只称到妓院助玲珑修书。千羽、晓晨劝喻父亲道出真相，中流不适倒地。

千羽求念念打听案情，念念对包拯照料有加，惹他起疑。晓晨到解语轩谋职，未能击败展昭，被玲珑拒绝。展昭得悉晓晨为救父混入解语轩，对她萌生好感。盗贼行劫交子店，逃走时伤及庞太师夫人。假交子流入市面，庞太师向包拯施压，着他查明真相。包拯怀疑王员外是印刷假交子罪魁，而中流的书坊被搜出王员外遗失的假交子，中流始道出曾见柳如嫣与王员外争执。千羽担任中流的讼师，指责包拯办案草率。包拯判中流斩首，此时如嫣出现……

中流向千羽坦承情倾玲珑，并与王员外合谋伪造假交子，父女不欢而散。解语轩因举办女子相扑客似云来，中流前来向玲珑求爱被拒。展昭、王朝奉命调查妓女铁荷花，荷花趁夜潜逃被玲珑阻止，并揭发她为抢夺交子而杀害王员外。包拯早有全盘计划，暗中与中流合作，望引出假交子案幕后黑手。千羽见中流被掳，救父心切亦被捉去。包拯等人及时赶到，欲拘捕一干人等时，犯人们却遭黑衣人刺杀。包拯嘉许中流父女协助破案，却见庞太师到临邀功。

念念到书坊投靠千羽，千羽提及晓晨当年被遗弃的往事。晓晨为赢得赏金借予亲母，求展昭教授相扑。庞太师提议由官府监管印制交子，仁宗委以重任。河边浮出藏有骸骨的木箱，众捕快尝试检验不果。公孙策跟千羽往酒坊，重遇旧友妻子沈青及友弟桑东城。公孙策因便溏症多次落第科举，仍屡败屡战，千羽得悉后大表支持。众捕快谈起开封府灯灭乃不祥之兆，未料公堂于深夜遭破坏。七子外出调查尸骨案，途中救起一女子，她竟称包拯是其夫君。

获救女子原来是包拯未过门的妻子张玉凤；公孙策请念念回开封府照顾玉凤，还看穿念念对包拯的情意。沈青被太安人责骂，得千羽、念念安慰。三女易装到解语轩作乐，遇上晓晨，千羽同意让她以绰号「火凤凰」参加女子相扑。公孙策向名医谈怀谷求诊，怀谷着他带走狗只吉祥饲养。玉凤得悉包拯曾与念念拜堂，心存妒忌，竟向包拯下媚药。众人发现另一副骸骨，疑跟先前检获的尸骨同为失踪状元。包拯率众到酒坊调查，太安人指沈青是杀人凶手。

众人推断案情，疑与桑东镇有关。玉凤上吊力证未曾下媚药，各人亦同称有物件失窃，包拯终解开闹鬼疑云。中流一家往打猎，中流本安排千羽和将军铁飞扬相亲，飞扬却对晓晨有意，晓晨无奈答应婚事。怀谷试探公孙策的品性后，答允替他治疗。公孙策自信可高中状元，欲扶持千羽当讼师协助包拯，二人目睹东城与一女子拉扯。沈青苦心供养东城读书，却见他无心科举，大感失望。包拯怀疑沈青与死去状元有不可告人的关系，而证供都指向沈青……

沈青认罪，但包拯认为案件疑点重重，千羽更深信沈青清白。东瀛魔女在相扑比试击败赛关索，晓晨出手遭飞扬制止，晓晨欲退婚。千羽通过包拯考核，成为汴京第一位女讼师。千羽誓还沈青清白，跟公孙策向东城了解案情。念念怀疑玉凤身分，暗地跟踪玉凤。念念、玉凤被掳，众人赶至救出二女。公孙策、千羽查明沈青案发时不在场，惟沈青仍坚持认罪。千羽拿出告密信证据，包拯道出有人插赃嫁祸，还当场指出凶手。深夜，桑家乌盆震动……

包拯查明东城与沈青之间的秘密，及三年前状元凶案因贩卖科举试题而起。展昭、飞扬为争夺发饰大打出手，展昭落败。晓晨见状，追问展昭心意，展昭却将感情藏于心底。包拯揭穿玉凤真实身分为阮初四，初四道出冒充包拯未婚妻的事情始末。包拯有感两次婚事告吹，查案亦结怨无数，怕为身边人带来不幸，得念念好言安慰。众人设局装成东镇回魂，真凶终承认所犯罪状。东城拒绝相信真相，包拯命展昭打破乌盆，证据确凿，真凶被判斩首……

有孩童尸首被挂在树上，众人着手调查。寡妇秦香莲带同儿子投靠亲戚简素秋，途中遇劫，得公孙策、千羽相助。东瀛魔女羞辱解语轩众女，玲珑邀晓晨出赛。包拯指公孙策患便溏症只因心病，怀谷终道出他患有消渴症。被杀孩童为管正之子，管正承认儿子乃过继。公孙策应考期间，遇上地震，及后因伤无法补考。庞金枝被困，获陈世美相救。展昭为晓晨特训，晓晨勇挫东瀛魔女。晓晨为避开跟踪，误登仁宗之船……新科状元世美出巡，香莲惊愕。

香莲怀疑世美是其夫君，托千羽试探。金枝再遇世美，二人郊游甚欢。仁宗为晓晨送上惊喜后离去，展昭与晓晨同赏花灯遇飞扬怒至，二子大打出手。飞扬告状，中流愿受杖刑，终令晓晨成功退婚。金枝与世美获仁宗赐婚，庞太师无奈谢恩。世美现身跟香莲相认，指被赐婚乃迫不得已，求她保守秘密。庞太师为世美设宴，众人到临缉拿管正。包拯怀疑拐卖孩童非单一案件，庞太师企图消毁证据。世美安排香莲母子登船游玩，船夫将二人推进河里……

展昭、王朝救起香莲母子；千羽察觉香莲有所隐瞒。众捕快撞破展昭、晓晨约会，展昭坚称二人纯属师徒。晓晨获仁宗提亲，始知他是皇上；众人推波助澜，晓晨终答允婚事。开封府调查拐卖孩童案，发现疑犯的无头尸首。金枝见香莲刺绣秀丽，请她指教。包拯率众至蝙蝠洞，惊见大量孩童尸体；及后追捕疑凶，发现案件与世美有关。公孙策回乡，得悉乡间发生多宗拐带孩童案。世美见金枝与香莲关系友好，怕身分败露，不惜拐走亲儿，要胁香莲。

世美狠心无情，香莲称有证据可指认其身分。素秋为救香莲而被杀，众人赶到，杀手却被灭口。包拯救出香莲儿子，香莲决意状告世美。公孙策、千羽提醒包拯若处理世美一案，或会与庞太师结怨。展昭为晓晨送上祝福，终坦承其心意。展昭外出喝酒失职，间接令张龙双目受伤。庞太师因世美所为震怒，金枝竟于婚前怀有世美骨肉。户部尚书庞令铎与拐子党勾结，包拯等前往拘捕，被庞太师捷足先登。众人安排乡里指认世美身分，乡里却称不认识他。

香莲于寺庙遇上金枝，并告知世美所为。金枝责备世美，反被世美以她腹中骨肉相胁。中流欲藉报章宣扬世美之事，书坊却遭破坏；王朝另被诬陷盗款。香莲因被恐吓，企图杀害世美，不果。怀谷替金枝诊症，还发现世美患上重病，要用至亲之血入药，方有生机。香莲患失心疯，世美带同香莲母子找怀谷，承认自己是陈二牛……公堂之上，包拯要将世美治罪，世美否认指控。庞太师着包拯惩治世美，世美胁持金枝欲逃走，激发金枝厥心痛……

伏兰遭活死人袭击，展昭等五子合力制止，并将活死人收押。公孙策认出伏兰是儿时救过自己的神仙姐姐，伏兰否认。活死人暴毙，并有中毒症状，公孙策、千羽查明伏兰身分。多名村民疑被活死人杀害，姜耿指活死人与庞太师有关。千羽向怀谷请教涉案的蓝色药物，从而得悉楼兰传说。庞太师透露毒药来自楼兰圣女，公孙策、千羽到封门山调查。二人向伏兰查探永生花，伏兰、祭师丘真达却称此花早已失传。二人再窥探伏兰房间，却有惊人发现。

公孙策、千羽欲逃不果，被困在活死人密室。公孙策为救千羽，服下活死人毒药。念念夜访玲珑，玲珑要她查出活死人的炼制方法。包拯与马汉往封门山调查，念念执意同行。活死人于闹市袭击百姓，得展昭与三捕快制止。包拯等发现活死人密室正烧毁尸首，却只见公孙策、千羽之物，包拯震怒。族人胡洵供称伏兰是主谋，包拯依楼兰族例判刑，要火烧伏兰；天降异象，火种熄灭，马汉向伏兰施斩刑，刀却折断。真达出示圣物，族人同意他暂当族长。

胡洵供词有可疑，包拯认为公孙策、千羽尚在人间。伏兰指责真凶杀害其夫，真凶坦承罪行。展昭带走真凶，欲套出公孙策、千羽下落，真凶突然中箭……包拯遭胡洵行刺，念念为他挡刀。活死人袭击千羽，公孙策毒发前向千羽表白。二人终被寻回，公孙策得怀谷治理后痊愈，千羽欲拒绝其爱意。玲珑讨好庞太师，并打听活死人一案。公孙策到牢中探望伏兰，予以安慰。包拯向念念道出心意，念念无惧相随遇险。伏兰逃脱，包拯认定是公孙策所为……

中流替玲珑送嫁妆到高昌，千羽随行，途中嫁妆被抢去。千羽谒见高昌公主，获告知念念身分有可疑。包拯、念念到安济坊探访孩童，包拯趁机向念念提亲，期间揭发坊内墙壁以空心砖所制。作头陈永涛涉贪，其兄兼工部尚书陈永昌扬言秉公处理。展昭按约定与师弟陈不凡比剑，不凡却坐着轮椅出现……公孙策、千羽跟踪念念，念念求二人将其假冒身分之事保密。展昭得知不凡死讯，陈松柏承认毒害孙儿。众人怀疑怀谷乃下毒者，怀谷竟直认不讳。

公孙策被包拯暂停职务，他替怀谷担任讼师。包拯恐断案有误，反得怀谷安慰。姜耿为死去的何家父子申冤，众人再作调查。永昌指证永涛，永涛承认受贿。包拯等向仁宗禀告空心砖一事，并指工部多人为庞太师亲属。庞太师曾向仁宗送赠贪赃之物，仁宗大怒。公孙策、中流发起百姓联署，替怀谷求情。庞太师召见牛雄，相告可解救怀谷的方法。中流、家庆率众在公堂外支持怀谷；公孙策呈上人证、物证，不果。包拯判怀谷斩刑，此时八王爷驾到。

八王爷取出丹书铁卷，欲救怀谷；怀谷拒绝其好意，坚持服刑。姜耿与大批百姓不适倒地，包拯暂放怀谷救人。包拯怀疑松柏包庇永昌，还查出永昌命人打伤不凡，方知不凡亲父另有其人。永昌乘乱逃走，展昭等人追捕，永昌却被黑衣人掳走。怀谷尽力施救，仍有多人不幸死于瘟疫。包拯怀疑瘟疫源于人为，播疫者反斥包拯是非不分，怀谷痛心。八王爷、庞太师率众向包拯施压，不果。八王爷、庞太师向仁宗求情，仁宗到公堂着包拯赦免怀谷死罪……

公孙策、千羽跟踪八王爷，天空忽现火药风筝。千羽怀疑念念另有图谋，与中流商讨对策。包拯上朝禀报工部多人指证庞太师受贿，庞太师突然吐血，太后求情，仁宗无奈仅将庞太师降职。晓晨怀上龙种，仁宗大喜。展昭与店小二朱达荣结缘，得知他有健忘母亲陈秀霞。众人追查工部爆炸案，八王爷担心涉事好友荣通泰遇险，说出往事。念念告知玲珑火鸟草图消息，玲珑看穿念念对包拯动真情。包拯率众捕快往捉拿涉案工匠李茂，屋内突然爆炸……

包拯、展昭屋外察觉端倪，众人避过一劫。念念质疑玲珑所为，反被玲珑下毒要胁。仁宗得悉开封府内有细作，命包拯查清细作名单；包拯对念念起疑。仁宗为保太平，愿接受辽国的不平等条件，八王爷力谏无效。晓晨被仁宗冷落，出巡遇见展昭，得其安慰。展昭、达荣与孩童耍乐，得悉安济坊有人中饱私囊。通泰探访秀霞母子，达荣指斥父亲。家庆遭绑上火药示众，疑被红花侠惩戒。千羽设局，确认念念的真正身分。念念如愿以偿，跟包拯成亲……

念念坦承身分，包拯愿为她放弃官位，着她供出细作名单。众人追查红花侠消息，惟红花侠已成人民英雄。庞太师欲纳玲珑为妾，太师夫人大怒，纠缠间太师夫人受伤。公孙策、千羽入宫为念念寻解药，却见晓晨遭太后留难。展昭等围捕红花侠，通泰赶至救走红花侠；原来红花侠正是达荣，父子冰释前嫌。众人推断出红花侠的身分，成功缉拿通泰。包拯呈上细作名单，仁宗答允免去一干人死罪。众细作被杀，解语轩失火，念念斥责包拯出卖自己……

包拯向念念指杀害细作非仁宗所为，推断玲珑尚有党羽。八王爷到大牢探通泰，二人均认为火器有助抗辽。辽国要胁仁宗赔款，包拯承诺想出对策。晓晨巧遇展昭被太后看见，仁宗责晓晨对展昭未忘情。中流、家庆宣扬抗辽，遭辽国使节耶律基喝止。耶律基当街调戏赛关索，姜耿出手阻止，被活活打死。包拯升堂审判耶律基，却传来圣旨要将他释放。达荣劫狱救出通泰，还以轰炸汴京相胁，要仁宗处斩耶律基。仁宗指耶律基要求交出念念，包拯坚拒。

包拯掷掉乌纱，痛打耶律基。耶律基着仁宗交出包拯，否则出兵大宋。中流、家庆呼吁百姓参军抗辽，众捕快提议包拯离开。耶律基在开封府外遭火器伏击，包拯趁机要他答允两国议和，耶律基无奈签下和约。包拯挽回民心，仁宗嘉许通泰父子研制火药有功。仁宗劝包拯与念念一刀两断，包拯宁弃仕途。玲珑出现，着念念以通泰父子换取解药，念念向千羽打听消息。展昭斥责念念自私，念念不为所动。念念袭击通泰一家，众人赶至，念念胁持通泰……

包拯难舍至爱，众人感自责。庞太师夫人被弃尸于开封府衙外，字条指庞太师是凶手。公孙策等当面推断案发经过，庞太师神情有异。太后怒斥庞太师，他反以当年秘密要胁太后……太后神智不清，误伤晓晨，仁宗不解。公孙策、展昭怀疑玲珑嫁祸庞太师，太后阻止二人追查下去。展昭找到线索，指中流疑是细作。千羽试探中流，终确认其身分，中流着千羽一同离开。包拯、展昭寻觅玲珑，遭伏击。中流带众人赶至要救包拯，玲珑对中流难以下手……

中流向包拯等人道出往事，但否认杀害辽国细作。中流喜与两女儿再聚，并提议晓晨离宫养胎。公孙策向千羽提亲，千羽终答允婚事。万慈禅院尸横遍野，晓晨惨遭不测，众人将幸存者寇珠送回开封衙门。中流称千羽非他所生，寇珠方是其亲母。包拯等向仁宗禀明事件涉及宫廷秘密，仁宗对太后生疑。太后劝仁宗勿追查三十年前之事，否则帝位不保。千羽、中流誓还晓晨公道，不惜出言顶撞仁宗。仁宗指二人论罪当诛，包拯等赶至，称千羽斩不得……

包拯指寇珠知悉龙裔秘密，求仁宗把案件交他审理，以还晓晨公道。太后曾否认杀害晓晨，仁宗感困惑。寇珠告知千羽身世，千羽誓要将太后治罪。仁宗命包拯彻查龙裔真伪一案，只求揪出真相。公孙策担心千羽被人利用，遂为太后担任讼师。八王爷力证仁宗乃太后亲儿，庞太师突然出现，说出重要证词。八王爷推举千羽接任皇位，惹百官非议。百姓议论千羽才能，千羽言论得百姓赞扬。千羽跟踪中流，终发现其图谋。七子赶到，但中流已有后着……

(大结局)展昭、王朝追查包拯父母下落，飞扬拒绝透露。众人对龙裔真伪各执一词，包拯求采纳千羽提议滴骨认亲，仁宗批准……中流叛逆图谋事败，杀害包拯父母作报复。包拯要将中流押返审讯，中流竟从塔楼跃下……千羽回复公主身分，却要嫁往西夏和亲，公孙策不舍。包拯指千羽出嫁时遇险，公孙策四出寻觅千羽。神秘女子声称能寻找亡魂，并可助包拯再遇念念。包拯在户外苏醒，却被指曾大开杀戒。念念出现，还突然向包拯施袭……