某月某日，中国某科学研究院，世界上首樽隐形药水终于研制成功，正当老科学家欢喜若狂之际，却未知杀身之祸已在眉睫。一直追随著他的研究助手，为了夺得这樽隐形药，抓起利刀将科学家解决！这宗罪行恰恰被清洁工人陈水井(林保怡饰)撞破，水井为了抢救老科学家，与助手纠缠起来，期间他的手臂被隐形药水意外溅著，神奇的事情发生了，水井的半截手臂竟在两人眼前隐形。助手为了逃避追捕，立刻饮了药水，令全身隐形，带著隐形药水逃之夭夭。

杂志社记者区志立(林家栋饰)，原与父母及妹区珊珊(杨千嬅饰)过著平凡而快乐的生活。任职保安组长的父亲区权，却卷入一宗巨型钻石失窃案，生活骤起波澜。对头杂志社记者卓颖(陈芷菁饰)，竟将事件报道成权监守自盗，令权更感冤屈惶恐。志立一面与颖闹得不可开交，一面又要安抚父亲，烦恼不堪！这时，权的同乡水井刚好来港，对失窃案追问不休，更直指贼人是个隐形人！志立岂会相信荒诞无稽之谈，只当水井脑筋有问题。

水井却找来女警辛晓岚(陈妙瑛饰)帮忙调查，志立对晓岚心生好感，担心好受骗，被迫一同追寻真相。正当水井要揭发隐形人的惊世秘密时，隐形人却意外被车撞死。死后的隐形人驱体重现，巨钻随即被晓岚上司、督察司马达华起回，权因此还得清白。追查隐形药水一事虽然不了了之，但却增加了志立对晓岚的好感，当志立鼓起勇气欲正式追求晓岚时，却被标梅已过、但眼高于顶的晓岚姐姐辛晓文从中阻挠，知难而退，一段大好情缘未开始便已结束。

志立性格正直，开罪了卓颖的上司兼男友徐力图(陈启泰饰)。力图为增加杂志销量不择手段，为报一箭之仇，设计令立志陷入捏造假新闻的陷阱中。志立不但遭黑道殴打报复，更令杂志社面临倒闭危机，烦恼无助之际，竟拾寻得水井遍寻不获的隐形药水。志立为救杂志社孤注一掷喝下药水，竟然真的变成隐形人，乘机找昤寻证据证明自己清白，平反冤案。

志立受新总编辑力图的打压，不得不陪同颖到惠东采访黑道。两人不幸卷入黑帮仇杀事件当中，志立被毒打一顿，颖更性命垂危！志立为救颖，竟导致自己陷入隐形困局。颖获救后暂时失明，幸有隐形的志立在旁悉心照顾，颖开始对志立改观。此时水井爱上晓文，正要展开热烈追求，晓文的旧情人Bob竟突然出现，欲与晓文重修旧好，两人情意浓浓，水井恨得牙痒痒。

力图得知颖是富商之女，急于向颖求婚。志立却发现力图与坏人勾结，遂向颖透露力图的恶行，但颖对力图异常信任，志立无端柱作小人。天网恢恢，力图恶行终被颖撞破，颖被力图欺骗感情，悲痛不已，幸得志立从旁安慰，终令颖解开心结，两人感情更迈进了一大步。颖重见光明，向志立示爱，志立欣然接受。

另一边厢，晓岚上级达华乘职权之便暗中追求她，更极力提拔晓岚升级。一次，晓岚被匪徒挟持，志立奋不顾身隐形相救，令晓岚不自觉迷恋这个神秘人。晓岚怀疑志立便是救命恩人，同时，得悉志立当日曾有意追求自己，可惜一切为时已晚，志立与颖已成一对，晓岚只得将感情默默藏于心底。志立误打误撞撮合晓岚与达华成为情侣，晓岚苦不堪言。

水井目睹Bob与一女子出双入对，追查之下竟发现Bob已是有妇之夫。晓文伤心欲绝，醉酒之下竟与水井发生关系，晓文只想当作没发生过，水井无奈。志立与水井查出隐形人现身的奥秘，原来在于晓岚的高频声音。于是两人求晓岚合作实验，令志立能对隐形现身控制自如。

富商蒋兆年妻子王曼娜激怒丈夫，兆年一怒之下更改遗嘱，将遗产继承权交给与前妻所生女儿卓颖。曼娜为保家产，竟暗地里派人将丈夫劫走，警方苦无对策。志立以隐形之便，暗中追查绑架案，但达华黄雀在后，坚持隐形人与绑匪同伙，意图将志立连同绑匪一并捉拿，志立腹背受敌，幸好有晓岚在背后相助，志立始能化险为夷，成功地救回兆年。达华查出绑架的主谋是颖的后母曼娜，曼娜入狱，颖与母亲卓玉芬得以重回蒋家，颖亦答允接手家族生意。

晓文与水井斗气依旧，晓文无意中发现水井竟倾家荡产大量采购小说，为自己新书造势，深受感动，终于接受水井。不过，两人交往后，晓文依然故我，对水井毫不尊重，水井忍无可忍发难大骂晓文。晓文明白自己的无理取闹，终向水井道歉，并承诺顺从水井。

隐形狗Bobbie突然暴毙，水井指志立可能步其后尘，众人担心不已。达华设陷阱令志立当场隐形，结果志立晕倒送院。晓岚恳求达华放过志立，达华无奈答允。达华又迫令志立、颖、晓岚三人摊牌，令晓岚伤心透顶，志立与颖的关系亦陷入危机。

力图偶然结识了蒋兆年的妹妹兆玲，竟利用兆玲渗透入蒋氏企业，继而利用蒋氏私通泰国黑帮进行非法勾当。志立揭发事件，力图被逐出集团，岂知力图早已部署好洗劫蒋氏的保险库。志立目睹案发经过，被力图与Ben打至隐形昏倒。达华认为志立是案件最大嫌疑人，故对志立穷追不舍。达华误服隐形药成为隐形人，被警局同僚毒打，终于体会到志立的感受，助志立拘捕力图。志立病情毫无起色，水井亦束手无策，晓岚、颖等人均感痛心。

力图走投无路，抢走水井的隐形药水，自此成为隐形人，更借隐形之便对志立痛下杀手，志立奄奄一息。医生宣布志立不治，晓岚、颖的呼唤却令志立死而复生。力图成为隐形人四出犯案，更意外获得自由控制隐形的能力。力图捉走颖，更欲将她与志立、晓岚三人一同灭口，天网恢恢，力图终于被警方拘捕。力图再度隐形逃脱，并与志立作生死斗，最后却意外堕进自己所设的局而死。

水井为了治好晓文的隐疾，研制出神奇生发水，成为有名的科学商家。晓岚迫志立表态，志立说出一生最爱其实是颖，二人终摒除心结、共谐连理。