经过沙士一役，仁爱医院众医生忘记伤痛，继续悬壶济世，医院亦重新正常运作。妇产科实习医生曾淑淇在同学林清伟的介绍下，观摩了程至美替柏金逊病人在清醒情况下做开脑手术。 程至美的手术十分成功，淑淇叹为观止，而清伟则决心要选修脑外科。淑淇因为离开岗位，被妇产科的顾问医生万安生斥责。程至美的前女友何心妍回港，两人约好了当晚饭聚，但是医院发现妇产科病房病人集体发烧，怀疑受到沙士感染，至美临时爽约，并返回医院启动绿色警报，又封锁妇产科，令医院顿时陷入恐慌。程至美与医生开会商议，王国彬对医院在怀疑沙士的情况下封院，引起病人恐慌感到不满，但黎国柱则认同程至美的做法。 快速测试结果证实病人并没有感染沙士，众人终可舒一口气。黎国柱不堪女友Jan的死缠性格，决定提出分手。何心妍被发现中煤气毒死亡，怀疑是自杀案，法医岑雅晴进行验尸工作。

志泓怒骂至美，认定他害死妹妹心妍，但他却对国柱说心妍曾向透露已结识新男友Tony，怀疑心妍之死和他有关，于是发电邮给Tony，希望了解他和心妍的关系。 敏智的内地病人荣总心脏病发被送到仁爱医院，他要求替病人转院，国柱无奈批准。敏智的豪装新诊所，希望借此吸引更多高消费病人。医院的新行政总监达贤履新，但原来他和心妍的父亲守仁是朋友，国柱担心至美的前途。心妍的验尸报告指她的死因并非自杀而是意外。达贤和至美等人出席心妍的葬礼，对至美表示希望两人合作愉快。勇明带女友和雅晴到仁爱医院，说发现心妍自杀前的生活和自杀没有分别。 至美从Tony口中得知他只是心妍的精神科医生，原来她生前已患上精神分裂！至美再去找雅晴查问，才知道心妍生前已有自杀倾向和患上厌食症，感十分伤心。

谭勇明向叶淘说敏智为钱才打官司，但叶淘却认同敏智因为歧视而告何守仁诽谤，并要他替敏智讨回公道。清伟如愿进入脑外科，而淑淇则考入了急症科。 一母亲将满身伤痕的女童带到急症室，国柱怀疑她受虐打，要淑淇看守著，可惜却被她们溜走了。素媛的手提电脑不见了，原来Joe不小心弄坏了，并拿去维修。敏智不知就里责骂儿子，Joe一气之下返回家。医院来了三名伦常惨剧的伤者，伤者原来是之前溜走了的母女。母亲失救，雅晴发现并非她丈夫所说是女死者斩人，突然男伤者发难挟持玉莹，又阻止医生替女儿施救，最后男伤者被制服，但女儿却死亡，至美一时冲动怒打男伤者。 众仁在制服男伤者时受伤，乘机提出和安生结婚。众仁想买新家私，玉莹因为家人经营家私店，于是主动提出给众仁折扣，但知道是为两人结婚之用甚感失望。至美在预备手术前，发现自己出现手震情况。

玲抱著洗澡时遇溺的儿子到急症室，原来玲是何德广的太太。现职中港货车司机的德广在医院重遇旧友国柱，互相问候一番。玉莹对众仁不死心，借词请众仁晚饭，众仁一口答应。 众仁相约玉莹食泰菜，并叫来了安生，玉莹大感无瘾。好友苏安茜建议她跟工木师傅到安生家，打探安生的品味，却被安生发现她偷看衣柜。送家私当日，玉莹又刻意送两张床褥给他们，揶揄安生年纪大。敏智的骨枯病情严重，叶淘建议他尽快进行换骨骹手术，但敏智拒绝。敏智往接Joe返宿舍途中再次病发，惟有借词有急症病人而不送Joe，Joe为此生气，父子俩再生误会。至美发现近日失眠、头痛和手震，于是求诊照X光。 玲再抱儿子到急症室，急召德广又没有回复，表现得惊惶失措，淑淇怀疑玲为了德广注意自己而故意虐打儿子。至美的X光片显示没有问题，但他却因心神恍惚而撞车。

志强对至美当日不让他应考医生执照，只能成为地位较低的物理治疗师仍耿耿于怀，适值至美要做物理治疗，志强便对他百般奚落，不过至美却根本记不起当日的事。 一名病人的手部伤势完全复原，但却要求叶淘填写伤残报告，好让他领取伤残津贴，解决一家经济上情况，可是叶淘执意不允。国柱看在眼中建议叶淘应以较温和的手法对待病人，但叶淘根本看不起国柱为人，并不将国柱的意见放在心内。未几，叶淘收到一个染血的洋娃娃，并且警方亦发现一具身怀叶淘覆诊卡的女尸，凶手与寄匿名信的犯人也是惯用左手，叶淘怀疑凶手就是另一名被她切除左手的病人所为。 国柱与叶淘在电视台相遇，恰巧节目主持食神突然哽到。国柱为救人扭伤腰部，众仁带他到自资开的脚底按摩馆，可惜却扭伤颈骨，医院上下立即传言国柱到风月场所消遣受伤。

玉莹又向众仁展开「追求」，要众仁送她回家，期间玉莹利用众仁手机拍下合照。众仁为免安生多心而隐瞒，可惜最终被安生发现照片，安生要求众仁日后向她坦白。 敏智骨枯后遗症开始发作，令他不可以长期站立进行手术，而且经叶淘诊治后，建议尽快进行换骹手术，不过敏智却断言拒绝。原来勇明曾找敏智商量，如果要胜出与何守仁的官司，就一定要证明他诊断能力并没有受骨枯影响。另外，敏智没法支付诊所昂贵的租金，结果业主迫他搬迁。心烦意乱的敏智并没有好好冷静，更不分情由地责骂儿子Joe，及后才知只是误会一场，更加内咎对母亲与儿子的态度，令敏智更加心力交瘁。 叶淘某日突然收到电话骚扰，而且凶手更近在咫尺，国柱追至但毫无所获。翌日，另一名病人再次遇害，令叶淘更加认定是因自己的关系而害死两名死者。

急症室送来一名因醉酒而跌倒的病人甘浩文，原来淑淇认识浩文，但浩文酒醒后四出捣乱更找淑淇麻烦。国柱向淑淇道出他记得淑淇亦曾自杀，要淑淇改变仇视轻生病人的念头。 对再有病人遇害，叶淘和雅晴更加怀疑凶手就是当日被叶淘切除右手的病人蒋超，但凶手有皮肤敏感的症状和蒋超不同，令叶淘百思不得其解。未几警方终于捉到蒋超，并且经化验DNA后，发现他并不是凶手，始让雅晴怀疑凶杀案与叶淘被恐吓无关，只因叶淘病人行动不方便，反抗力较弱才因此扯上关系，于是加强警力在医院范围巡视。适值玉莹扭伤脚踝后被凶手看上，凶手在向玉莹施暴期间被警员撞破，始揭发凶手正是医院中的装修工人。 清伟因疲劳过渡晕倒，国杉却对其冷嘲热讽，志强不甘好友受辱出言指责，争执期间，至美赶至调停但被推动在地，曾总欲解雇志强，但至美却向曾总求情挽留志强。

众仁欲以结婚来与安生和解，可是安生觉得要周详计划。不过当安生看到一名病人，因种种原因而迟迟未能与所爱的人完婚时，觉得不因错过大好姻缘，毅然答应众仁的求婚。 敏智重回仁爱医院工作，不过仍在适应期间，女朋友素媛又突然与才子艾力高调地以情侣档的姿态回港。某天艾力心脏病发被送到仁爱医院，同行者竟是素媛，令医院上下更加议论纷纷。敏智于是和素媛「摊牌」要求分手，素媛悻悻而去。敏智母亲又突然来医院找敏智，可是敏智因公私两忙疏忽母亲的需要，原来敏智妈妈患上心绞痛来找他诊治，后更因此令心脏病发，被送院后证实不治，敏智始觉疏忽照顾家人。 玲某天带著还是婴孩的忠仔来求诊，至美立即动手术急救，可惜婴孩最后失救至死，至美却将所有责任归咎于自己能力不逮，竟欲图轻生。

至美仍对忠仔的死内疚非常，引致性格变得异常暴躁，雅晴怀疑至美患上抑郁症，于是想尽办法安慰至美，要他去看心理医生，但至美讳疾忌医，根本不听雅晴的意见。 敏智母亲病故，再没有亲人照顾儿子Joe，而且精神科医生诊断Joe仍未能平复婆婆之死的打击，建议除让Joe接受心理辅导外，亦可寻助养家庭，令Joe再感受家庭温暖。但敏智不想与Joe分开，还立誓要好好地照顾Joe，可是Joe仍恼敏智的疏忽至令外婆病死，两父子相对而无言。敏智为哄Joe开心，给Joe吃士多啤梨雪糕，但Joe突然出现皮肤敏感，敏智再觉须要与儿子好好沟通，但可惜Joe已经不再想与敏智对话。 至美患上抑郁症后，喜欢将自己封闭，更跑到郊外远离人群，却遇到一名钓友被夹进岩石内，至美于是想尽办法救出这名钓友，自此至美顿感人生充满意义，终肯接受心理辅导。

至美开始接受临时心理学家治疗。众人深感安慰之余，亦意识到要多些关心身边人。至美休假期间，以保龄球打发时间，某日遇上雅晴，至美向雅晴道谢之余，更告诉她不应只顾眼前而忽略身边事物，想法与当日自怨自艾的他完全不同。 近日，医生常被病人投诉，医院高层大为烦恼，尤其因敏智与何守仁官司，令周刊的狗仔队常假扮成病人，向敏智「套料」，敏智「自己知自己事」主动向曾总道歉，曾总却安抚敏智，加强保安人手维持秩序。 另方面，洪太因丈夫的关系，借故投诉淑淇，还心情大坏坚持要堕胎，令众医生大为烦恼。但原来洪太是国柱的忠实读者，于是国柱以亲笔签名安抚洪太，令淑淇更加欣赏他。 医院来了一名伤口受伤甚深的病人，原来该病人在伤口搽上腐蚀药物，借此勒索一些私家医生，而其中一名私家医生正是美娟的同学，美娟于是找她报警作证。无意间，美娟撞见甘浩文劝阻其债仔勒索私家医生，令美娟大感奇怪。

曾总误会淑淇与国柱二人正在拍拖，还对淑淇的选择感到非常满意，刚巧淑淇亦对国柱有意思，竟主动约会国柱。在约会当晚，淑淇虽然刻意盛装打扮，但国柱竟在约会途中记挂著工作，令淑淇一怒而去，国柱茫然。 当日被至美击伤的病人坚持投诉他，曾总希望增加透明度，要知情的医生提供资料，国彬忍受不了因至美被投诉而增加同袍的负担，竟出言责备至美。 安生在中学时的孕妇朋友Vivian再次扭伤脚而入院，经叶淘观察过后，认为Vivian患上产前抑郁，而且安生又发现Vivian搭上有妇之夫，令安生加倍担心她，但Vivian表示自己不会放弃自己和腹中块肉。 何守仁被Tracy的死打击甚深，对Tracy的无私牺牲的下场不值，性格变得很自私和无情。但另一方面，至美在雅晴的劝慰下，重遇沙士康复者，令他感到人生光辉的一面和努力不懈的精神，终于从Tracy死后打击的阴影中走出来。

玲被送往精神病院后情况反复，丈夫德广只感心痛，唯有转职开直通巴士，尽量抽时间回港探望玲，某夜他亲眼目睹一名电单车飞车党超速跣倒后，将女友弹出车外撞伤脑部，被送入院抢救，德广顿感当年的行为不当，还主动安慰伤者。 安生中学好朋友Vivian脚伤痊愈出院，但仍需接受家居物理治疗。但当志强来到Vivian家门前时，发觉Vivian开煤气自杀，志强拚命为Vivian抢救，惜最终失救至死，而安生亦立即剖腹取出婴儿，虽总算救回婴儿，但志强却非常内疚自己医术不精，救不回病人。 原来Vivian的手下正是安生前男友Bosco，他直言不介意安生即将结婚，还想与安生再续前缘，但遭安生断拒绝。 至美在医院外遇上Joe，还教会Joe自己绑鞋带，后发现Joe原来是敏智的儿子，但却对Joe抗拒别人的行为奇怪，敏智道出原因，令至美看出敏智的另一面。素媛欲找至美访问，但此事惹来医院高层不满，但原来至美只是婉拒了素媛的邀请。

素媛朋友因脑肿瘤爆裂入院。经众医生诊疗后，发现病者原来脑内仍有肿瘤需动手术切除，而且危险性极高，至美却要求由他亲自操刀动手术，可惜素媛害怕至美精神病发作影响手术，敏智得悉后怒责素媛歧视至美，素媛无言而对。 医院送来烧伤的女病人Jan，原来她是国柱的朋友，然而因Jan与男朋友的问题常找国柱倾诉，令叶淘更以为国柱到处留情，对国柱冷淡起来。 另一方面，医院送来一名喝下整瓶咳药水的弱智人士杰仔，原来杰仔是勇明昔日当差时拍挡的弟弟，同袍去世后，勇明成为杰仔的监护人，但屋村的小混混却利用杰仔的弱智缺点图利，令勇明气结。 敏智不肯接受换骹手术，仍死忍痛楚继续上班，但常常因病痛忽略儿子的需要，于是最终肯接受叶淘的建议，进行换骹手术。而且，敏智的官司终于完结，何守仁最终获胜，但何守仁竟不追讨损失之余，还提出聘请勇明为他办事。

淑淇愈来愈对国柱有意思，还四出打听国柱的消息，然而同袍们对国柱的评价却毁过于誉，认为他为人花心滥情，但淑淇仍旧主动追求国柱，还暗示可以进一步发展。然而，国柱总是以似有情却无意的态度对她，令淑淇无奈。 杰仔出院后，仍旧终日与屋村的小混混来往，还被他们骗去钱财，勇明看得怒火中烧，但反被杰仔指责勇明终日事忙，根本疏忽照顾他，勇明只好带著他出席与雅晴的约会。至美想到推荐杰仔到办公室工作，好让他可以自力更生。结果，杰仔上班后即被老板赏识，令勇明大感鼓舞，故此放心让杰仔自己生活，可惜小混混们仍不肯放过杰仔，骗去杰仔刚发的薪水。 敏智接受手术后行动不便，于是请叶淘代为照顾Joe，叶淘施尽爱心，终于令Joe肯与人接触，还将Joe带到敏智前让敏智哄儿子开心，令Joe再次与敏智沟通。然而此事被雅晴看在眼内，取笑雅晴对敏智有意思。

仁爱医院护士们自发举办义工活动，叶淘奉召探访老人中心讲解医护常识，刚巧遇上国柱亦有参加，国柱还因为落力示范健体运动而跣倒地上。因此令叶淘对国柱大为改观，不再认为他是一名花花公子。 雅晴和勇明从至美口中得知，杰仔已有多个星期没有上班，雅晴和勇明于是上门探望他，恰巧遇到杰仔又再与屋村小混混大旧等人来往，恨铁不成钢的勇明严厉地责骂杰仔，翌日更强迫他上班，但杰仔对上班极之反感，竟然在复工的第一天殴打一直善待他的李老板，更爆出李老板曾性侵犯他！勇明内疚没有好好照顾杰仔之余，不理李老板的苦苦哀求，决定起诉他。 杰仔被侵犯后受到极大的心理伤害，变得愈来愈细胆，勇明怕杰仔再被骚扰，欲要与杰仔同住，可惜二人却被发现惨死在公寓内，现场更被凶手用漂白水清洗过，就算经雅晴不眠不休地检验，都没能取得任何线索。

李老板突然受伤入院，他虽坚称被老婆打伤，但雅晴来到为李老板检验后，益发认为他嫌疑最大，可惜却缺乏证据。另外，警方从保安系统中发现，大旧曾在凶案现场出没，雅晴推断大旧可能是凶案的唯一目击证人。 雅晴日以继夜希望能找出真正凶手，可惜徒劳无功。恰巧警方人员无意中发现大旧踪迹。在追捕期间，大旧却发生交通意外重伤晕迷入院，雅晴大为紧张赶至，可惜大旧却最终伤重不治，勇明被杀一案线索完全中断，而李老板亦因杰仔身故没法出庭出供，结果获无罪释放，雅晴得悉后几近崩溃，竟跑到医院天台意图轻生，幸被至美发现，几经劝阻下，雅晴终肯放弃自杀念头。 国柱与叶淘继续在社区中心当义工，叶淘赫然发现甘浩文亦是义工的其中一人，然而叶淘得悉甘浩文的病情已到末期，力劝他回院检查，可惜甘浩文宁住在简陋公寓，也不肯回院接受治疗，叶淘无奈。

安生近日脾气暴燥、经期不准之余又时常头晕作闷，众仁以为她怀孕而高兴不已时，但经验孕后，事实却令他好梦成空。安生道出不想冒高龄产妇的风险，婉拒为众仁诞下婴儿，众仁顿感无奈。 淑淇眼看叶淘与国柱的关系日渐密切，感到相当不快，竟忘记与清伟的约会，而主动跟叶淘和国柱参加义工活动。但在社区中心内，淑淇重遇甘浩文，淑淇冷淡地对待他。 未几，甘浩文与人争执引致骨折送院，但他的行为古怪，竟在众人前大爆淑淇身世。精神科医生诊断甘浩文的肝脏的毒素随血液上脑，令他行为失常，必须立即进行换肝手术续命，可惜甘浩文坚拒接受手术。 雅晴对勇明的死大受打击，上司批准她放大假，但雅晴将用尽所有时间去消遣，根本是自我折磨而不是休息。至美知道此事后，立即前去安慰她，更陪她度过一个晚上，终于令她从勇明去世的阴影走出来。

甘浩文拒绝接受手术，众人深感无奈。恰巧他在医院的公园内巧遇Joe，还教晓Joe吹奏牧童笛，令Joe终于展现笑容。未几，Joe来到敏智办公室，看到敏智熟睡如死，Joe以为他发生意外，令他再次开声呼救，两父子终于冰释前嫌。 淑淇找国柱倾诉心事，原来甘浩文当年是她最祟拜的音乐老师，但某日妈妈突然带著她改嫁甘浩文，但自此妈妈却郁郁寡欢，最终因心脏病发而死，所以她归咎于甘浩文破坏掉她美好的童年生活。可是事实上并非如此，原来当年是曾总有外遇在先，妈妈愤而改嫁在后。淑淇始知误会了甘浩文，非常内疚，借酒浇愁，并觉得难而面对曾总，私自搬到国柱家中暂住。 众仁的行为变得愈来愈古怪，众蓝担心，找安生研究对策。安生无意中发现众仁准备去接受绝育手术，在众仁施手术的当日，众仁道出不想安生冒高龄产妇的危险，安生却告诉他，已怀了他的骨肉。

雅晴经至美的安慰后，开始接受情绪康复治疗，并且转职至仁爱医院工作。 敏智对叶淘展开追求，关心之情路人皆见，至美乘机取笑他，敏智却直认不讳，不过却说不会勉强，一切顺其自然。 医院送来一名交通意外引致半身不遂的病人康仔，并由叶淘成为其主治医生。本来，康仔从没想过放弃自己生命，还以伤残之身考取学位。但原来康仔与母亲宝姨相依为命，虽然，宝姨为康仔的医药费疲于奔命，但为人却极有原则，还路不拾遗交出拾得的彩票。但康仔却眼看妈妈每日工作的辛劳，感到自己连累母亲，竟然发电邮到报馆，要求让他安乐死，令宝姨伤心非常。 自从曾总的风流史被揭后，淑淇变得自暴自弃，某日更喝得烂醉被劫去身上所有财物，唯有致电向清伟求助，清伟看到淑淇的醉态后，却感无力安慰淑淇，唯有将她送回国柱身边，淑淇在国柱怀内痛哭后倦极而眠。

康仔寻安乐死，宝姨用工作麻醉自己；安生、众仁看后深感不忍，后来发觉宝姨原来为购买康仔的医疗仪器，让他可回家中疗养，才风雨不改回按摩馆工作，于是安生发起慈善捐款活动，希望能帮忙宝姨解决金钱上的问题。 淑淇得悉曾总有外遇后，失去成为医生的人生目标而不去参加医生考试，国柱立即怒骂淑淇不负责任，但她却反指自己没有将来，根本不值得奋斗。适值，叶淘无意中发现，康仔原来是国柱的忠实读者，亦因国柱的一篇文章，才萌轻生的念头，于是怒斥国柱是不负责任的作者。国柱将淑淇的故事告诉康仔，希望他能放弃轻生之念头，惜康仔又以没有将来为借口，根本听不入耳，叶淘听到国柱的劝慰后，才知又一次误会了他。 众人一直误以为雅晴和至美可成为情侣，但原来雅晴与精神科的Dr. Lee是旧相识，Dr. Lee亦主动约会雅晴。而另一方面，素媛终于用诚意打动至美接受访问，而至美亦觉与素媛「情投意合」，并没有抗拒与素媛「借故亲近」。

经产前检查后，妇科医生怀疑安生的胎儿患有唐氏综合症，两夫妇大受打击。二人表面上虽然装作平常心，但众仁心底却非常失望，刚巧一对还未完婚的「老夫妻」洪婆婆与陆伯伯同时送院，更加令众仁感叹世事无常。 陆伯伯被送入院后，住在康仔隔邻病床，宝姨藉两人的故事以激励康仔求生意志，但意志消沉的康仔根本听不入耳。叶淘偶尔发现，康仔的身上有一个刻有「Iris」的纹身，宝姨道出，康仔未出事前经已结婚，本来两夫妻恩爱非常，但妻子Iris在康仔出事后便一走了之。然而，叶淘却认为只有Iris才能激励康仔，欲追查Iris的下落；叶淘在敏智面前提起此事，两人对婚姻的看法南辕北辙，令叶淘对敏智的印象立即大打折扣。 急症室送来一名智障少女贝贝，经众仁检查后，意外地发现她给同事诱奸成孕，贝贝父母认为她没有照顾儿子的能力，欲进行堕胎手术，手术由安生负责操刀，但进行手术前，强烈觉得贝贝对要诞下胎儿的执著，对自己是否堕胎变得犹豫起来。

Joe的亲生妈妈Martha回港探望敏智两父子，令叶淘错过与Joe庆祝生日，敏智于翌日立即向叶淘解释，但她表示毫不介意，还劝Joe接受Martha，冷静得令敏智完全没法专心工作。而原来Martha来港是为了希望能接Joe同住，但敏智坚拒Martha的要求。 雅晴与至美的感情仍旧很好，但二人始终未能成为情侣，雅晴向叶淘说与至美二人所背负的感情包袱太多，对双方都是压力，故雅晴不介意跟Dr. Lee约会，反而难与至美踏出第一步。但另一方面，至美偶遇德广，听到德广剖白心路历程后，惊觉自己无必要离群独处，故不介意接受素媛的「追求」，不过至美却对素媛的开放态度有所保留，但反觉她率直及想法独特，希望可以慢慢发展。 一名少女受伤入院后嚷著要离开，淑淇发觉她就是康仔前妻Iris，本来淑淇有意将联络地址交给徐医生，但因徐医生是曾总的「前情妇」关系而没有帮忙，徐医生跑到Iris公司要求她去见康仔，Iris初拒绝，后却私底下探望，宝姨道出Iris根本不知如何面对康仔。

安生决定除去腹中胎儿，找众仁「商量」，众仁大怒认为安生没有理会他的感受，结果安生将决定权交给众仁，众仁犹豫，竟通宵在医院「守夜」不回家，又避开安生不见。玉莹眼看此事后，责众仁逃避不是办法，又道出安生面对的压力，劝服众仁回家与安生「团聚」。 康仔病情急转直下，经叶淘诊断后，始知主要原因是康仔的消极情绪影响，令疗程进展事倍功半，宝姨无奈。及后，叶淘在无意中发现，宝姨原来身患绝症，但因宝姨一直以不放弃的态度，以及要照顾康仔的精神，令病情得以控制，令叶淘大感母爱伟大。 另一方面，洪婆婆担心自己死后没人照顾陆伯伯，竟然乘夜间没人偷偷地想杀死丈夫，幸给宝姨发现阻止，不过此事给康仔看在眼内。 素媛积极与至美约会，更主动勾引至美上床，大胆示爱，可惜为国柱所阻。 另外，国柱终肯面对现实，向淑淇坦白只是出于好心，才收留她至今，并希望她能尽快搬走，淑淇伤心。

清伟近日受病痛困扰，经诊断后，发现他原来患有多元性化学敏感，毒素已经积聚甚深，甚至影响日常生活，于是他毅然辞职。志强却怒斥他太易放弃，至美出面调庭，令志强一怒而去；至美追至，道出志强将自我愿望投射在清伟身上，没理清伟感受，志强默然。 自从Martha回港后，叶淘开始拒绝敏智的约会，Joe有心撮合二人，故约叶淘回家聚餐，由自己准备晚饭，甘浩文刚巧经过，教Joe用简单菜煮出合意款式时，但突然病发入院；曾总安排甘浩文到外国接受治疗，出发前，甘浩文写了一封信给淑淇，两父女终于冰释前嫌。 Martha正式向敏智要求取回Joe抚养权；翌晚，敏智强吻叶淘向她表白，叶淘断然拒绝，此事却让国柱看在眼内。 雅晴与Dr. Lee约会频繁，虽然Dr. Lee对雅晴照顾有加，可惜雅晴始终提不起劲和他发展，及后，雅晴与Dr. Lee到曾与至美共膳的「大牌档」，始知对至美碓实有感觉。 另一方面，国柱变得害怕面对淑淇；在酒吧独自喝酒，遇到德广，经他开解后，国柱独自回家面对淑淇，二人取得共识就算不能成为情侣亦始终都是朋友。

德广任职巴士司机来往中港两地，一时不慎发生交通意外被送入院；表面上虽没大碍，但经国柱诊断后，发现德广因工作需要常强忍内急，竟患上慢性肾衰竭，要进行换肾手术。得知此事的至美前往开解，德广反认为已习惯人生无常，至美感动。 在德广的交通意外中，受伤骨折的病人Albert原来是花花公子一名，连学生也不放过，他垂涎主诊医生叶淘的美色，极力追求。叶淘不假以辞色，国柱承诺替她解围。 与此同时，Martha要抢回Joe的抚养权，但多次接触敏智均吵架收场，叶淘劝敏智平心静气地与Martha商量，敏智却谓Martha没有理会Joe的意愿，叶淘不以为然。及后，叶淘从与Joe的对话得知，Joe原来对母亲非常陌生，叶淘才明白敏智为儿子担心的态度。 雅晴与Dr.Lee约会后，发现二人根本不相衬。另外，素媛得知德广入院后，立即以她为名发起慈善活动，又找来大批记者宣传，更要至美替她安排德广妻子接受访问，至美怀疑素媛正利用他们的关系，令她获选为杰出青年。

Dr.Lee欲到外地进修，但怕与雅晴的感情变淡，找雅晴商量。雅晴鼓励他去尝试，并且道出他们性格不合，两人和平分手。另一方面，至美觉得素媛为人太过功利，决定与她分手。国柱得知至美失恋后，大感快慰；叶淘亦劝雅晴接受与至美的感觉。 敏智与Martha的争子案仍然继续，敏智对官司并不乐观，叶淘开解他不要太绝望，敏智道出，最希望能由Joe自己决定。Martha为争取Joe的好感，要求带他外出，Joe却强拉敏智一同出席，Martha怪责敏智使用手段分化她们母子，敏智直斥她没有尊重Joe的意愿，Martha默然。适值淑淇误诊，病人心脏病发，敏智怒斥淑淇无能，淑淇一怒之下提出转到心脏科向敏智学习。 德广妻子玲突然在精神病院寻死，更写下遗言将肾脏捐给德广治病，德广明白一切恩怨已成过去，决定接受玲的「道歉」，及后却发现他们的血型根本不适合。 美娟的丈夫要人合资到内地搞生意，但因此而冷落了她和儿子熹仔，美娟唯有带熹仔到医院上班以便照顾。

自从众仁夫妇二人决定生下智障儿子后，众仁变得珠辎必计，因为要给子女有个美好的将来，落力储钱；玉莹反赞他是个好男人，令人有安全感，两人越来越投契。而安生亦因怀孕的关系，情绪变得不稳，更加依赖众仁。 美娟证实患上淋病，质问丈夫昌后，始知昌常借搞生意为名，流连内地的烟花之地，故患上性病。本来昌承诺不再到内地鬼混，美娟亦原谅了他；可惜，美娟又再发现昌与损友结伴鬼混，掉下儿子让她照顾，美娟怒极而去。刚巧，有病人无理取闹美娟的工作态度，向院方投诉，上司国彬力撑美娟并没有做错，反而和任职投诉科的妻子Amy争吵起来，美娟感激。及后，美娟托众仁照顾儿子，经众人追问后，道出丈夫不忠的秘密，众愕然。 Joe突然被送入院，经诊断后，得知Joe竟患上极罕见的遗传病，但根据敏智的病历，绝不会诞下此病儿子，敏智怀疑Joe并非亲生儿子，前去质问Martha，Martha无言而对。此事被淑淇看在眼内，敏智要求淑淇保守秘密，淑淇答应。

雅晴突然请假独自游布吉，留港的至美大感寂寞。至美在医院遇到被切除右脚的病人胜仔，启发他不要错过身边事物，决定向雅晴表白，二人终成情侣。但忽然素媛入院进行身体检查，竟发现患上恶性脑肿瘤，素媛要求至美陪她过余下的日子。 敏智与Martha的争子官司完结，法庭将抚养权交给敏智，但他却认为，外国的医疗水平较高，对Joe的病情有帮助，结果将抚养权交给Martha；敏智向Martha道出，虽然Joe非他的亲生儿子，但已视为己出，要Martha好好地照顾他。敏智找叶淘陪他购买礼物给Joe，又向叶淘表白；但叶淘却心系国柱，竟在敏智面前购买礼物给国柱，又断然拒绝敏智的追求，敏智仍不死心，决定以好朋友的身份慢慢交往。 安生近日常感身体不适，但仍坚持工作。病人陈太难产，安生竟不理会自己身体状态，坚决进行手术，手术后不支晕倒，因此引致流产，安生和众仁大感失落。 美娟决定与昌离婚，不理丈夫的哀求搬出住所，整个人却变得轻松，更积极地面对工作。

素媛患上脑癌情况严重，于是利用工作麻醉自己欲渡余生，至美即前往安慰；但素媛却斥至美医术并不足令她活命，意图轻生，至美赶到终劝她打消念头。至美感身边女伴常生不幸，怪责自己。令他对雅晴仍紧张起来，雅晴连忙安慰。 敏智力追叶淘，但叶淘情倾国柱，但国柱迟迟不肯表态，令三人陷入交著状态。淑淇转到心脏科工作，常面对敏智的刁难，淑淇认为她是国柱的徒弟所致，怪责国柱。国柱道出由于性格关系，害怕在感情上负责，伤害彼此，故在叶淘感情却步，宁愿继续过一夜情的荒诞生活，淑淇责备他不敢面对现实，要他好好反醒。但国柱依然故我，竟继续「猎艳」，更被敏智撞破，敏智惊告国柱不要伤害身边人，令国柱更加冷落叶淘。 安生小产出院后，即离开香港到外地参加朋友婚礼兼散心，众仁大感无奈，借酒浇愁。刚巧众仁家中大床损坏，找玉莹的家族装修公司帮忙，竟不慎在大床上留下耳环，被安生回港后无意中发现，安生怀疑众仁不忠，整夜不能成眠。

自安生误会众仁有外遇后，变得终日疑神疑鬼，一方面刻意讨好众仁，另一方面则细心留意他的行为；安生终于发现玉莹配带一条与众仁同款的手机绳，以及玉莹又失去了一只耳环，认定她就是众仁的「情妇」。 素媛得病，至美拼命帮助，因而冷落了雅晴。虽然雅晴大呷干醋，但仍然在背后默默支持至美，让他无后顾之忧。但素媛却利用至美的关怀，常藉小事要至美陪伴她。素媛更私下找雅晴示威，说定要抢回至美。雅晴大怒，责素媛不应利用至美，要素媛放弃，素媛执意不允。及后，敏智接素媛出院，再劝素媛放过至美，素媛反击指敏智同为自私的人，根本没资格批评他，更说出自己时日无多，要至美一世都要记著自己。 叶淘癌症复发，经诊断后，发现癌细胞入骨，于是找曾总商量工作上的安排，并要求曾总保守秘密，曾总答应。恰巧叶淘前男朋友Ivan的妻子被送入院，令叶淘忆起当年分手亦因不欲影响身边人，故此不理国柱的表白，反到敏智家中向他倾诉。

叶淘醉倒在敏智家中，醒来发现敏智对她细心体贴，叶淘感动之余，更借故向敏智摊牌；敏智明白到叶淘情系国柱，只视他为好朋友，故主动要求维持朋友关系。恰巧叶淘外出被淑淇遇到，淑淇即前去质问国柱如何对待叶淘，国柱茫然。 雅晴愈来愈妒忌至美对素媛的态度，叶淘劝雅晴应好好向至美说出自己感受。至美仍然继续为治疗素媛而奔波，更请来外国专业医生为素媛动手术，根本没空理会雅晴；素媛突然留书跳楼自杀，至美极度伤心。及后，至美收到素媛写给他的遗书，明白到素媛害怕面对失败而死，至美心痛。另一边厢，雅晴亦为素媛的死大感失落，认为素媛的死带给至美很大遗憾，亦将会影响他们二人间的感情。 安生怀疑玉莹是众仁情妇后，常假公济私针对玉莹，安茜看不过眼向安生反击，玉莹奇怪询问安茜为何近日的情绪起伏失常，安茜不答。恰巧国彬妻子Amy突然滥药送院，揭发安茜就是国彬情妇。众仁终向安生解释外遇疑云，二人和好。

志强终于明白人各有志，主动找清伟修好。雅晴在病理科交流期限已到，众人都希望她留在医院。雅晴偶尔发现叶淘癌症复发，始知她对国柱却步的原因，启发雅晴应趁有生之年做自己喜欢的事，结果她再投入法医工作。 众仁发现玉莹偷吻他之后，发觉玉莹仍对他存有感觉，于是刻意避开她，玉莹苦恼。安茜辞职后，积极找新工作，但眼看玉莹的苦恼，而「过来人」的身份，劝玉莹好好考虑她与众仁的关系。恰巧玉莹遗失与众仁同款的手机绳，变得神不守舍。安生拾获后找玉莹倾谈，二人互相试探；安生觉得玉莹对众仁充满爱意，回家后立即向众仁道出玉莹的苦恋，并要他认真面对玉莹的事，众仁苦恼。 德广病危被送入院，极需肾脏移植才得保性命；但他的血型恰好是稀有品种，只能听天由命。医院突然有病人因车祸随时去死，其血型又与德广配合，可是当伤者遗孀听到受益人是德广时，竟拒绝捐出肾脏。

病人杨先生脑干死亡，随时去世。但其遗孀拒绝捐赠肾脏给德广续命，经至美打听后，始知杨太就是德广的旧友陈心宁，可惜因德广在醉酒后一时错手将其男友Mike打死，故特别憎恨他。虽然至美多番劝解心宁，心宁坚决拒绝捐出肾脏。 医院突然送来一名堕楼少年家乐，经抢救不治，其父母认定凶手是当日杀死勇明和杰仔的疑凶李仕琛。雅晴接手验尸，发现家乐明显曾被性侵犯，而且据家乐的遗书中，仍清楚指出李仕琛曾对他施暴。可惜又因李太太作时间证人，警方因证据不足放走了他。及后被雅晴得知李太太因此患上情绪病救医，欲向主诊医生Tony套料，至美对雅晴做法颇有嫌词，后来才知只是误会一场，二人最终和解。 安生要众仁认真面对玉莹，二人摊牌，承诺维持朋友关系。众仁因安生的不信任而失落，藉醉向玉莹道出心事，竟情不自禁互相接吻。众仁糊涂地向安生供出一切，安生怒极而去。 叶淘虽然多番努力避开国柱，但不敌自己感觉，与国柱正式拍拖。

众仁激怒安生不敢回家，寄住在国柱家中。叶淘正式对大家宣布，与国柱拍拖及患癌事实，大家忧喜参半。国柱碍于众仁常作「电灯胆」欲赶走他，众仁失声痛哭，国柱无奈。玉莹认为众仁对她有意思，不甘心就此放弃，安茜却劝她尽快抽身。 敏智开始力追淑淇，除传授医术心得，又在病人前力撑她。不过淑淇仍对敏智存有偏见。敏智趁机约会淑淇，有心撮合父女见面，淑淇一怒而去，敏智追出。淑淇道出，敏智欲利用她讨好曾总，敏智反指淑淇不成熟，未够资格成为其女友，淑淇默然。敏智又帮淑淇整理家电，淑淇再次指看穿敏智另有目的地讨好她，敏智指两人皆为不择手段的人，正好互相利用，最后还强吻了她，淑淇愕然。 素媛为德广撰写的生平传记面世，众人皆感唏嘘。心宁突然来找德广，德广向心宁置歉。原来心宁看罢素媛遗作，得知德广唯一未了的心事是向她道歉，故特意前来了结恩怨，可是最终心宁仍不愿意捐出丈夫的肾脏，德广却安然面对。

心理医生Tony致电至美，告之李仕琛太太失踪，至美怪责雅晴向李太施压引致她情绪病发，雅晴无奈。及后李太自杀入院，除令她流产外，还变成植物人，至美将责任完全归咎雅晴，雅晴坚持自己没错，二人吵架收场，至美更因此提出分手。 敏智升职，成为心脏科高级顾问医生，而且更得曾总刻意提携，让他接手高难度手术，令他能扬威海外；医院立即流言四起，认为他只是靠淑淇的关系，就连淑淇也认为自己功不可没，但敏智却认为一切皆是靠自己实力所得，一于少理。刚巧，在敏智进行手术中，另一病人病发入院，国柱不依院方指定程序，不待敏智手术完毕，将病人送往心脏科，不幸医院电梯故障，病人心脏病再次发作，差点危及病人性命，敏智怒极。 虽然李太自杀前揭发李仕琛有娈童倾向，不过因李太患病的关系，令他又再无罪释放。受害者父母追出法庭，混乱间李仕琛被推倒在地，令他脑瘤爆裂而死。但雅晴却撰写其死因报告为自然而亡，又再惹来至美的怀疑，两人又再大吵起来。

国柱不依程序辨事，几危及病人，敏智大怒向曾总投诉，国柱承认自己责任，医院众人皆替国柱不值，认为敏智假公济私向国柱报复；淑淇闻讯赶往开解国柱，又再找曾总求情，更指责敏智有心作弄，敏智听后反指淑淇处事不成熟。 众仁目睹雅晴约会旧情人李医生来找至美，至美道出两人须要冷静处理双方感情，在场的安生劝至美以行动挽救感情，至美笑而不答。众仁得到启示，欲主动哄回安生，解释他与玉莹的关系，但安生却认为众仁只是在逃避三人间的问题，根本没问清楚自己是否真的对玉莹有感觉，反而更加愤怒，众仁无奈。 另一边厢，叶淘劝雅晴尽早修复与至美的感情，勿让感情转淡，雅晴又笑而不答。 雅晴独自郊游欲散心，可惜被山贼所劫，还将她绑在山中；恰巧，该贼人形可疑被警察追捕，竟因此引发严重车祸，连曾总也被牵连在内。加上，当日雅晴陪同送院的孕妇，怀疑染上传染性极高的猴天花，急症室引发大混乱。

曾总车祸入院、至美为寻雅晴失踪，医院失去决策层引发大混乱。经众顾问医生开会后，为阻止猴天花疫症爆发，决定暂时封锁急症室，等待疫苗救援。原来当日因车祸送院的病人中，涉及两派黑帮火拼，他们更在急症室打起来，更令叶淘受伤。 安生将众仁和玉莹一同隔离在医院的储物室中，孤男寡女共处一室，安生对二人非常没信心。而在储物室的二人从闲谈间，扯到感情的话题上，众仁惊觉玉莹对他仍充满爱意，又再让众仁面对考验。 至美在山中终于寻到雅晴，可惜至美不幸随雅晴跌下山坡，及后二人终被救出时，雅晴得知至美无视她染有疫病陪了她一晚，雅晴感动莫名。二人最终和好收场。 在急症室被隔离的病人突然心脏病发，国柱立即电召敏智救亡。可惜敏智以下班为尤拒绝，原来敏智若进入隔离区，他便无法到美国出席重要会议；结果责任落在守夜的淑淇身上，但敏智忽然出现接手手术，令淑淇立即对他另眼相看。

猴天花疫症终于得到完美解决，急症室被解封，大家亦返回工作岗位。解封后玉莹即找安生解释她和众仁的关系；而众仁亦立即回家，向安生坦白一切，并道出已经想通日后如何面对引诱，自此安生的疑虑尽去，两夫妻感情跨进一大步。 曾总伤重不治，在弥留期间，主动向淑淇道歉，两父女终于和好；在病房门外的另一边厢，至美向敏智道出，曾总绝不放过任何可救活别人的机会，尽心尽力帮助病人的情操，更打算在死后捐出肾脏救回德广，启发敏智如何成为一个真正的好医生，于是毅然放弃远附美国成为大国手，以及再和儿子Joe重聚的机会，留在仁爱医院继续当顾问医生。此番举动令淑淇大为感动，终肯接受敏智的追求。 叶淘自晓得国柱因得悉她癌症复发后，才对她展开追求，开始冷淡对待他。国柱积极修补两人关系，但无奈叶淘却认为，国柱根本没法改变他害怕守诺的性格。二人不约而同地用国柱生日为分手的楔子，虽然彼此仍深爱对方，可惜却知已没法再在一起。