五魔星阻止李夫人之胎出生，李靖与金吒、木吒成功拦截。李夫人诞下怪球，怪球走出一个矮细的小子，李靖认为小子是妖怪，把他打走。太乙真人收李家三公子为徒，并为他取名哪吒。李靖为哪吒请来老师，但哪吒无心向学。

哪吒在墟集看见闻太师的心腹陈大人横行霸道，于是易容教训了他一顿。陈大人到李家追究事件，金吒、木吒、哪吒一同受罚。哪吒嬉水时触怒了东海龙王三太子，三太子誓要报仇。哪吒砍了母亲种的树深感内疚，向母亲道歉。

哪吒打伤西山妖精，妖精因疗伤而突袭三太子。三太子与哪吒大打出手，哪吒打死三太子，更挑走龙筋。龙王大怒，哪吒得太乙真人教导后，以武劝服龙王。哪吒误杀石矶娘娘的两名徒儿，李靖只好把哪吒留下给石矶娘娘处置。

石矶娘娘被太乙真人说服，哪吒逃过一劫。南海龙王决要替东海龙王报仇，金吒、木吒化身成哪吒欲为弟顶罪，惜被识破。其后两人再出手阻止龙王找哪吒却被擒。哪吒得知后到龙宫找龙王算帐，西海龙王与北海龙王赶来支援。

四海龙王误以为哪吒已死，大仇已报。原来哪吒被救是太乙真人所安排。姜子牙被众师兄劝服下山，更被宋异人安排婚事。哪吒找东海龙王报仇，龙王要李靖一同找玉帝评理，哪吒赶来与李靖脱离关系后，自尽死在母亲怀中。

哪吒报梦请母亲为自己打造金身神像，待三年便可回复元身。杨戬得知父母已离世，往找兄长杨钊。曱甴精得知自己貌似「哪吒大仙」，借此作恶。杨戬为回避兄嫂荆如花，提出到父母山坟守孝。曱甴精化身公子到如花的家前…

王婆使计让荆如花与曱甴精化身的公子见面。杨钊得悉其妻红杏出墙回家捉奸，惜被奸夫杀死。杨戬得知杨钊已死的事实，往找哪吒合力对付妖精。荆如花准备逃走时，杨戬出现把荆如花及曱甴精杀死，并自动投案杀害兄嫂。

东海龙王及石矶娘娘因哪吒奸污民女之事找李靖，李靖因而得知建哪吒庙一事。杨戬将被处斩，姜子牙冒生命之险请县官重审案件，替杨戬脱冤。小妖们、山神及土地公虽向李靖解释事件，可是李靖仍坚决挥剑毁了哪吒的金身。

哪吒金身被李靖毁后，太乙真人助哪吒以莲花化成人。姜子牙道出邓婵玉今生也没有姻缘。哪吒找李靖报仇，可是被道厄真人制伏，更要哪吒与李靖言好，哪吒誓死不屈。哪吒被释放后向李靖施袭，燃灯道人以玲珑塔收服哪吒。

燃灯真人告诉李靖他与哪吒的前世恩怨，并将玲珑塔送赠李靖来管教哪吒。邓婵玉赌气比武招亲，并逼杨戬表白。姜子牙经元始天尊解救后，重新投入工作，为收伏琵琶精向李靖借帅印，并表示会讨伐纣王，还询问李靖的意向。

邓婵玉找指腹为婚之丈夫土行孙解除婚约。邓母怕女儿喜欢穷家子，派人欲杀土行孙及杨戬。土行孙被袭，幸得老伯相救，并要求老伯取自己双眼，助母重见光明。纣王派闻太师查琵琶精被杀事件。李靖命哪吒保护姜子牙离开。

金吒、木吒暗杀闻太师失败，闻太师即时要求入住总兵府。哼哈二将被指施妖术，李夫人找闻太师询问却惊见他吃掉下人春桃，当场晕倒，李靖要求闻太师解释，并一同回朝面圣。岂料翌日李靖被削去职权，更将会被处决。

李靖为了百姓，当众叫闻太师为「爷爷」。李靖找闻太师对决，不敌被捉。邓母要求土母交出婚书，遭拒，于是派人杀了土母。惧留孙命徒弟土行孙下山辅助姜子牙。杨戬救走李靖，与李夫人重逢，怎料闻太师施法将三人带走。

闻太师欲将李靖及杨戬烹煮炼成丹丸。哪吒为救父母，却也被困，幸得杨戬及李靖协助，顺利逃出山洞。皇上急召闻太师回京。土行孙本欲投靠李靖，却被哼哈二将劝服改投闻太师。土行孙不甘邓玉婵爱上杨戬，决与杨戬对决。

李靖、杨戬得山神相助，终回复自由，而哪吒亦回复真身。四魔误震龙宫，与四海龙王打起来，四海龙王不敌弃宫逃离，无奈下找哪吒帮忙。邓婵玉向土行孙表明自己只喜欢杨戬。哪吒借词以拜祭三太子为名，跟四魔到龙宫。

哪吒令魔礼青病发，于是找翠云仙姑取紫丹参，而四海龙王趁机抢回龙宫。土行孙欲与杨戬决斗，幸邓婵玉出现制止。四海龙王阻止魔礼青疗伤，哪吒把四海龙王吓退。杨戬甘愿退出，可是却拒说不喜欢邓婵玉，让土行孙气忿。

土行孙骗走姜子牙要胁杨戬。四魔收到捉拿李靖的任务。金吒、木吒终回家团聚。杨戬虽破土行孙的五遁术，但仍救不了姜子牙。四魔得知李靖是哪吒之父，要求放人，哼哈二将趁机挑拨土行孙及四魔。四魔答应哪吒找回李靖。

土行孙不敌四魔，带走姜子牙，四魔趁机救走李靖等人。姜子牙成功让杨戬助其脱险。土行孙逃走后与四魔言好，合谋捉拿姜子牙。姜子牙感负累李家，自愿被四魔押解上京。李靖、哪吒等人往救姜子牙途中，遇上土行孙挑衅。

哪吒被土行孙绑走。惧留孙劝土行孙改过，并救回哪吒。邓婵玉幪面与杨戬对打，哪吒不知就里，将邓婵玉打至重伤死亡。哪吒找四海龙王帮忙救姜子牙，四海龙王想出换走四魔兵器之计策。双方打斗时，四魔发现兵器失效……

三魔战亡，大哥魔礼青也死在哪吒手上。三太子对哪吒穷追不舍，哪吒答应三太子办完要事，到龙宫解决两人的恩怨。李夫人突然晕倒，哪吒找太乙真人帮忙，却得知母亲难逃一劫。李夫人灵魂被锁走，哪吒扬言要到地狱救母！

哪吒在地狱看见母亲受苦，欲带母亲离开，却被阎王阻止，大黑、二黑趁机逃离。阎王答应若哪吒捉回大黑、二黑，便让李夫人还阳。哪吒失忆被傅夫人收为义子，取名小宝。小宝找到大黑、二黑，却不慎失足，从树上跌下……

小宝多次拿起物件欲袭击大黑、二黑。周文王见姜子牙以直钩钓鱼后，请其帮忙。杨戬见到与哪吒相似的小宝，告之姜子牙，并向傅夫人提出带小宝回陈唐关。小宝与大黑、二黑碰到哼哈二将，大黑、二黑被打，小宝出言制止。

小宝昏迷不醒，大黑、二黑往找东海龙王取「逆骨还魂珠」，惹三太子不满，穷追二人欲取回珠，二人却变成鸽子。龟丞相救了一老伯，要对方捉拿哪吒。小宝被捉，幸太乙真人及时将老伯收伏。后龟丞相、小宝被震至山谷下…

判官捉回大黑、二黑，并带哪吒一同回地府。阎王要哪吒的灵魂通过火海，就让李夫人还阳。燃灯道人提议将大黑、二黑化成风火二轮，阎王答应。杨戬不敌哮天犬，幸元始天尊指点，终收伏哮天犬。哪吒与闻太师等展开激战。

（大结局）哪吒找太乙真人求助对付闻太师，闻太师亦请来通天教主协助。哪吒找四海龙王往救人，并以乾坤圈紧锁闻太师，意图浸死及火烧他，但给闻太师逃脱反击，幸哪吒使计，与四海龙王成功铲除闻太师，李靖等人得救。