《洗冤集录》著于宋代，是法医史上的惊世巨著，而其作者竟是一个饱受歧视的棺材遗腹子，三十岁前，他一直靠打更为生，不料一宗命案却改变了他的命运。

因分地纠纷而找村长理论的宋慈(欧阳震华饰)与劫富济贫的江湖女贼唐思(宣萱饰)，意外地卷入了谋杀村长案中，被判死刑，后得到新知县宋翊(林文龙饰)及熟悉验尸的马贵相助，沉冤得雪。翊聘慈为忤工，两人合作下屡破奇案，声名大噪。另思因翊再造之恩，暗生情愫，但翊已与聂枫(陈妙瑛饰)发展感情。

一名长相与宋翊一模一样的人突然出现，原来翊为求功名，冒充知县，为掩饰罪状，翊将真宋翊杀死，又攀附权贵，抛弃枫而娶富家女蓝彩蝶为妻，岂料蝶家早已外强中干，负债累累，翊有感蝶为其负担，故设计陷害。翊的奸险面目渐渐表露，但每次行凶时均非常谨慎，彻底毁尸灭迹，慈无计可施之际，竟意外地发现了真宋翊的尸体，究竟慈能否将翊绳之以法呢？